在《鲨卷风5》中，不可思议的鲨鱼世界末日之后，人类陷入了困境，经验丰富的鲨鱼猎人芬·谢泼德发现自己需要一把更大的电锯。Fin被困在一个陌生的遥远的土地上，面对着毁灭性的Sharkzilla带来的难以捉摸的复杂性，一个意外的时间旅行者打破了时空连续体，启动了超越物理现实的终极救援任务。因此，芬和几位久经沙场的战友不得不利用时间的奇迹，打击邪恶的根源。现在，为了创造历史，芬必须先重写历史。世界准备好迎接新时代的黎明，迎接最后一次大鲨鱼的结束了吗？

英国政府邀请抗击鲨卷风的英雄芬?谢泼德参加关于抵御鲨卷风的高级会议。但他的好友诺娃在此时紧急联系他前往巨石阵探寻人类祖先抵御鲨鱼的秘密。两人在神秘洞穴中取得神器，却没想到引发了大规模的风暴，无数鲨鱼从天而降，世界各地接连遭遇灾难。芬和诺娃匆忙赶回，与半机器人的妻子阿普里尔和小儿子吉尔并肩作战。然而风暴太过猛烈，诺娃没能保护好吉尔，致使他被卷入风暴。芬和阿普里尔心急如焚，想方设法欲进入风暴救出儿子。他们被风暴带到瑞士、澳大利亚、巴西、意大利和日本，所到之处哀鸿遍野，一片狼藉。这时，被海上核废料污染发生变异的鲨鱼愈发凶猛，芬的家人朋友纷纷殉难，噩耗接踵而至。痛心疾首的夫妇二人将何去何从，他们将如何阻止灾难的继续？