星泉（药师丸博子 饰）是一名普通的高中女生，母亲早年去世，父亲亦在最近因车祸离开人间，她孤零零地与父亲的情人麻由美（风祭雪 饰）生活在一起。星泉的远房亲戚是黑帮目高组的组长，如今只剩下四个人的目高组成员为完成组长遗愿，请求星泉代替她的父亲继任组长职务。 　　星泉不忍见成员们走上亡命道路，同意就任，并拜会上层帮会头目滨口（北村和夫 饰）。数日后黑木刑警（柄本明 饰）向星泉透露其父之死与毒品有关，麻由美亦牵涉其中。星泉开始调查父亲死因，而幕后黑手也展开了行动。弱小的目高组面临被摧毁的命运……

怪奇现象调查组织SSP成员某天收到了来自艾克斯奥特曼的变身器艾克斯终端。有雨落入了敌人的陷阱，特殊防卫队Xio的队员大空大地（高桥健介 饰）被迫与艾克斯奥特曼解除了一体化的联系。在此之后，大地下落不明，艾克斯奥特曼值得拜托SSP和红凯（石黑英雄 饰）寻找大地。另一方面，时刻企图将美丽的东西变成宝石据为己有的邪恶外星女魔头穆鲁娜奥，而今正打算把地球变成宝石。与此同时，暗黑军团伽古拉也蠢蠢欲动。地球面临最大的危机…… 　　本片在日本国内61块银幕上同时公映，首周初登场观众满意度排名第一位。