草薙素子之后，巴特与侦探出身的陀古萨结为搭档。近期发生多起机器人偶杀害主人继而自杀的事件，由于受害者家属均无公诉，且死者中有政客与公安官员，于是公安9课派出巴特小组调查此案。杀人人偶皆为荒凉地带公司出品的哈德莉机型，应部分顾客要求，该机型同时具备异性玩伴的功能，巴特从荒凉地带公司出货官遇害入手，卷入与黑帮的战斗，期间有人入侵他的大脑，使其自残。　　巴特决定直奔荒凉地带总部，他与陀古萨拜访了择捉岛上的黑客基姆，后者布下系统陷阱，幸有素子提出警告避免陀古萨陷入控制。依靠基姆这条线索，巴特登上了荒凉地带公司设立在海上的工厂船，素子再次降临他的身边，与其并肩作战。

第四次忍界大战结束的两年后，此时此刻的漩涡鸣人（竹内顺子 配音）早已成为盖世英雄一般的人物，无论他走到哪里都受到女孩子和小朋友的喜爱与追捧，他似乎也有其享受这样喧嚣欢闹的氛围。与之相对，壁花小姐日向雏田（水树奈奈 配音）则始终站在角落里，默默注视着这个她喜欢了多年的男孩子。雏田亲手为鸣人织了围巾，怎奈无法鼓足勇气交给对方，喜欢的话语更难以说出口。某个夜晚，雏田的妹妹花火（浅井清己 配音）遭到不明身份之人劫持，带火的陨石则落在附近的山坡之上。为了救回花火，阻止地球毁灭，鸣人、雏田、小樱（中村千绘 配音）、鹿丸（森久保祥太郎 配音）和佐井奉命前去调查舍人（福山润 配音）的真身。在此过程中，鸣人不小心知晓了雏田的心意……　　本片情节介乎《火影忍者》漫画699话和700话之间

2002年在TV版内容再次编集的基础上，上映的两部∀高达的动画电影《地球光》和《月光蝶》。

在天下失序、列强割据的战乱时代，僧人祥庵将一名孤儿从中国带到了日本。孤儿名叫仔太郎，他背负着一个惊人的秘密。与祥庵失散后，孤苦无依的仔太郎带着爱犬飞丸前往赤池之国的万觉寺，在途中遇见了神秘剑士“无名”。仔太郎遭到追杀，危急时刻无名救了他一命。从此两人结伴同行。性格乖僻的浪人和紧闭心扉的少年虽然磕磕碰碰不断，但渐渐成了好朋友。　　白鸾率领的追杀组织还是抓住了仔太郎，他们开始着手筹备某种仪式。金发碧眼的剑士“罗狼”也是追杀组织中的一员，他虽然听命行事但并不真正在意组织的目的，对他来说，寻找可以与自己匹敌的对手才是生命的意义。罗狼与无名之间的生死对决拉开了帷幕……

这部作品风格类似于大和古装片，背景却发生在未来的日本。在不夜城新宿，人类和妖怪和平共处。但是，曾几何时连环杀人案连续发生，而罪犯是叫廻向的神秘男人。为何曾经是街之守护使『鸦』的他会向人类复仇呢？　　为了阻止杀人案继续发生，新的『鸦』诞生了，青年音羽被选作新的守护使，新仇旧恨在新宿街头开始蔓延……　　鴉 KARAS　　故事簡介—　　在不夜城新宿，人們早已忘記存在於身邊的妖怪，　　大家都過著浮華糜爛的生活。　　這兩個互相重疊的世界，　　自古即由「百合音」與「鴉」兩者負責維持秩序；　　但是，這種平衡關係已開始出現傾斜，理應捨棄一切的自我，　　註定成為街頭僕人的「鴉」，　　卻突然自稱為「迴向」並開始對人類展開復仇行動。　　大街上接連發生了數起離奇殺人事件，　　而兇手正是透過迴向得到全新軀體，　　被稱為「御座眾」的機械化妖怪。　　此時，新宿車站的月台出現了兩名男子，　　一個是為了偵辦離奇殺人事件而從本廳派遣來的菁英警部「吳」，　　另一個則是為了打倒迴向而重返新宿的流浪妖怪「燖」。　　由於受到人類社會的常識規範，使得吳一直無法找到解決事件的線索；　　相對的，_則順利地追查到了御座眾成員之一的河童。　　正當_手持來福槍瞄準河童時，另一對百合音與鴉剛好也在此時出現，　　他們才是透過新宿的龐大意識而誕生的全新城市守護者……